A ce jour aucun effet secondaire négatif n'a été rapporté. Néanmoins, les personnes qui utilisent l'EFT se doivent d'assumer la pleine responsabilité des résultats qu'ils obtiennent avec ces techniques. Il est vivement recommandé de faire preuve de bon sens et de ne pas appliquer l'EFT aux personnes ayant des problèmes importants, à moins d'avoir les connaissances nécessaires pour le faire.

Certaines personnes ont été si gravement traumatisées et/ou ont subi des choses si graves dans leur vies qu'elles ont développé des problèmes psychologiques importants ou des troubles sérieux. Alors que l'EFT s'est avéré être d'un grand secours même dans des cas si graves, DANS DE TELS CAS L'EFT NE DOIT ETRE APPLIQUE QUE PAR UN PROFESSIONNEL QUALIFIE AYANT DE L'EXPERIENCE.